變電站需要GPS時間同步系統的原因有以下幾個方面：

保證設備協調運行：在變電站中，有大量的設備需要協調運行，比如變壓器、開關、繼電器等等，這些設備需要精確的時間同步，以保證它們的運行是協調的、穩定的和安全的。如果設備之間的時間同步出現偏差，可能會導致設備的誤操作、故障等問題，嚴重的甚至可能導致安全事故。

保證數據采集的準確性：變電站中需要對大量的數據進行采集和處理，這些數據包括電能計量、電流電壓等測量數據、設備狀態數據等等。這些數據的準確性對于變電站的運行和維護都是非常重要的，如果數據采集時間的不準確，可能會影響數據的準確性，從而影響對設備運行狀態的判斷和分析。

保證系統對外時間同步的準確性：變電站的運行和維護需要和外界進行時間同步，比如和電力調度中心、電力市場等進行數據交換和通信。如果變電站的時間同步出現偏差，可能會影響與外界的通信和數據交換，從而影響變電站的運行和維護。

提高系統安全性：時間同步對于變電站的安全性也是非常重要的，比如在故障發生時，需要快速準確地確定故障發生的時間和位置，從而可以采取有效的措施來處理故障。如果時間同步不準確，可能會導致故障處理的延誤，從而影響系統的安全性。

因此，變電站需要GPS時間同步系統來保證設備協調運行、數據采集的準確性、系統對外時間同步的準確性和提高系統的安全性。